有证书芯片的是不是都是纯种？
1 首先，这个题目就有问题，“有没有证书不知道，但是是不是都可以通过一些方法鉴定出来？” 从理论上来说，只要测出了DNA序列，就可以判断该物种是否杂交过（当然可以忽略测出的基因片段是杂合还是纯合，以及是否是自交）。不过，现在测一个个体的DNA成本还是非常昂贵的，大概需要数千元人民币。所以通常的方法是先测量两个不同地区同一个物种群体的DNA序列，然后比较这两个群体间的差异（用统计的方法计算两个群体每个基因位置的基因型频率和基因突变的等位基因频率的差异），如果差异在可接受范围内，说明该物种没有近亲繁殖；否则，说明存在近亲繁殖。这个方法的缺点就是无法知道具体是哪两个个体发生了杂交。 但是，目前通过这种方法已经能够分辨出人、鼠等哺乳动物（包括家养动物）是否存在近亲繁殖了[1-3]。至于其他脊椎动物比如鱼类、鸟类等是否适用这个方法还有待进一步研究。 当然，也有其他方法的，最近看到了一篇文章用线粒体测序来估测海洋鱼类的近亲繁殖[4]。但是，我对这个方法不是很了解，文章也没有详细解释原理和数据处理过程，所以就没有细读了。
2 关于第二个问题，我只有一点看法。 人类基因组计划已经完成了大部分人的基因组测序，并且公布了其中一部分数据(humangenome.org)。这些基因组的数据库可以作为鉴定近亲繁殖的一个资源库。但是，这些人基因组数据库中的基因片段都是整体抽取的，可能无法捕捉到某个个体特定的变异位点。另外，人的基因组大小大约是30亿个碱基对，目前已经完成测序的大约是95%，还有大约5%的基因组还没有被测定。虽然已经完成测定的部分已经包含了大约60万个基因，但还有大约30万基因还没有检测到。 所以我觉得单单根据一个人基因组的数据来判定这个人来自哪里、是否有近亲繁殖的历史是很不靠谱的。毕竟人类的遗传多样性非常低，只有1~2%的人类个体是不同的基因型的（不同基因型的个体也就是基因突变的个体，我们一般称为AABB式个体）。绝大多数人是AaBbCcDdEEFF类型的（简单说就是同一个基因的不同拷贝有不同的变异类型，如AB基因有两个拷贝，一个是Aa，另一个是BB，CCDD等等。因为同一个基因的两个拷贝通常是不相同的，所以AaBB类型的人通常也是有CcDdEEFF类型的人的后代。）